In Ubuntu Oneiric hat sich ein Patch eingefunden, der dafuer sorgen soll, dass das Papierformat nicht zu A4 im Default wird. Das sorgte bei mir dafuer, dass auch Dinge, die eigentlich A4 werden sollten im US-Letter Format als PDF generiert wurden.

Die Loesung dafuer sieht so aus, dass man entweder mit den Kommandos \pdfpageheight und \pdfpagewidth das Ausgabeformat korrekt setzt, oder ein Package verwendet, dass sich bereits darum kuemmert. Das ist Beispielsweise das "geometry" Paket: \usepackage{geometry}

Wenn man eigene Vorlagen verwendet, kann man das Geometrie Paket so einbinden: \RequirePackage{geometry}